jueves, mayo 11, 2006

Descubrimiento de IBM sobre el funcionamiento del genoma humano

IBM anunció que sus investigadores han descubierto numerosos patrones de ADN que son compartidos por ciertas áreas del genoma humano que se pensaba que tenían poca o ninguna influencia en su función y las áreas que sí la tienen. Tal como se informa hoy en Proceedings of the National Academy of Sciences "PNAS", ciertas regiones del genoma humano que se suponía contenían en gran medida material evolutivo sobrante denominado "ADN" basura en realidad pueden contener importantes pistas que podrían ser de gran utilidad para ayudar a los científicos a comprender los procesos celulares. Los investigadores de IBM han descubierto que estas regiones contienen numerosos cortos "motivos" de ADN, o fragmentos de secuencias repetidas, que también están presentes en partes del genoma que dan lugar a las proteínas.En caso de lograr ser verificado experimentalmente, el descubrimiento sugiere la existencia de una conexión potencial entre estas partes codificadas y no codificadas del genoma humano que podría tener un profundo impacto en la investigación genómica y dar lugar a importantes conocimientos sobre el funcionamiento de las células. El equipo de IBM usó una herramienta matemática llamada descubrimiento de patrones "comúnmente utilizada para extraer información útil en repositorios de datos muy grandes en aplicaciones tanto de negocios como científicas", para filtrar una cantidad de letras estimada en seis mil millones en las regiones no codificadas del genoma humana y buscar fragmentos de secuencias repetidas o motivos. Entre los millones de motivos descubiertos, el equipo identificó aproximadamente 128.000 que también se producen en la región codificada del genoma y que están significativamente sobre-representados en los genes involucrados en procesos biológicos específicos tales como comunicación celular, regulación de la trascripción, transporte y otros. De hecho, las copias de uno o más de estos motivos pueden encontrarse en más del 90% de todas las secuencias conocidas del genoma humano, así como en algunos genes de otros animales donde se asocian con procesos biológicos similares.
ppmt2006.-

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